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DNA鉴定之多重单碱基延伸SNP分型技术

来源:http://www.zhkysw.com/news/234.html   发布时间:2020-04-28

由美国应用生物学公司开发的Multiplex SNaPshot主要针对中等通量的SNP分型项目。在包含测序酶,具有四个荧光标记的ddNTP,接近多态性位点5个末端的不同长度的延伸引物和PCR产物模板的反应系统中,引物的延伸被一个碱基终止。用AB测序仪进行凝胶电泳后,可以根据峰的颜色知道掺入碱基的类型,从而确定样品的基因型,并根据峰所在的凝胶位置确定与延伸产物相对应的SNP位点动作。

PCR产物的模板可以通过多个PCR反应系统获得。与其他SNP分型技术(RFLP,Taqman,SNPstream)相比,多个单碱基扩展SNP分型技术具有以下优点。

①打字准确,其准确性仅次于直接测序。

②同时检测多个基因座最多可同时检测12个基因座,而RFLP和Taqman-一次只能检测一个。

(3)不受SNP位点多态性的限制,并且该位点是G / C,A / T,G / A,C / T还是插入/缺失多态性,可以在一个系统中检测到。

④不受样本量的限制。

⑤可以检测出污染的样品。如果样品的打字光谱偏离正态分布,则表明样品可能已被污染或浓度过低,而其他打字方法无法做到这一点。

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